Japanese San Francisco Bay Area Seminar

BAS主催 UCDセミナー 2月19日（金曜日）午後6時30分

2016年、第二回目のBAS主催 UCDセミナーです。Department of Plant Biologyの野末　一成さん(Ph.D)に,“R/Bioconductorを使った大規模データの料理法—再現性と公共性を目指してー”という演題でお話しいただきます。


野末一成さんに, 本セミナーで、野末がこれまで得られたデータを中心に、R/Bioconductorを用いて大規模なデータどのように解析していくかなどを解説いただきます。


セミナーの後、懇親会もありますので、ぜひご参加ください。

演題：

【R/Bioconductorを使った大規模データの料理法—再現性と公共性を目指してー】


講演者：野末　一成　(Kazunari Nozue Ph.D.)

所属：University of California, Davis, Department of Plant Biology


私は、これまでに植物の成長リズムの解析、トランスクリプトーム解析、突然変異体の網羅的表現系解析などを通じて、比較的大規模なデータを無料のR/Bioconductorを用いて解析してきた。 一旦、Rスクリプトを書いてしまえば、アップデートした実験データをもとにした解析結果が即座に得られるので、大規模な実験を行いながら、同時にその結果を解析して次の実験の計画を練るなど、エクセルでは不可能な迅速で正確なデータ解析が可能になる。今回は、私の仕事でのR/bioconductorの使用例を用いて、R/Bioconductorの長所と短所、そしてソフトウェア開発プロジェクトのための共有ウェブサービスであるGithubを用いた誰でも検証可能な実験解析の公開についても議論したい（Nozue (2015) PLoS Genetics 11(4): e1004953参照）。


日時：

2月19日（金）18:00　開場　=>　18:30　講演開始


場所：Plant Reproductive Biology Bldg, Conference room

建物の入り口には案内係を配置しますが、もし入ることができなければ村田(408-687-4225)まで電話をください。


参加費：

$5（軽食を用意します）、学生無料


申し込み：2月18日までに、村田まで連絡願います。